Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Prm2P07978 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms