Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06321 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06321 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06321 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06321 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
P06321 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06321 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06321 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06321 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06321 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06321 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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