Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04214 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04214 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04214 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms