Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01822 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01822 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01822 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01822 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01822 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01822 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01822 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01822 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01822 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01822 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms