Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setdb1O88974 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setdb1O88974 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms