Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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