Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ptpn9O35239 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ptpn9O35239 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ptpn9O35239 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ptpn9O35239 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ptpn9O35239 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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