Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm21887J3QQ04 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Gm21887J3QQ04 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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