Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm2056J3QQ02 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm2056J3QQ02 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm2056J3QQ02 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm2056J3QQ02 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm2056J3QQ02 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm2056J3QQ02 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm2056J3QQ02 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm2056J3QQ02 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm2056J3QQ02 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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