Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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