Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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