Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ms4a18J3QN01 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms