Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms