Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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