Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms