Protein–RNA interactions for Protein: J3KMK6

Gm21775, Predicted gene, 21775, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21775J3KMK6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21775J3KMK6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms