Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms