Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms