Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms