Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm10477F6SW83 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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