Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd1E9PZ26 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms