Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms