Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pm20d2A3KG59 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms