Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm5640A3KG49 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5640A3KG49 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5640A3KG49 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5640A3KG49 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm5640A3KG49 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm5640A3KG49 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm5640A3KG49 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm5640A3KG49 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5640A3KG49 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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