Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms