Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms