Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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