Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms