Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms