Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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