Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syngr4Q9Z1L2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms