Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nme3Q9WV85 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms