Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms