Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcm1Q9R0L6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms