Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap3b2Q9JME5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms