Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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