Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CtsmQ9JL96 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CtsmQ9JL96 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CtsmQ9JL96 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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CtsmQ9JL96 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtsmQ9JL96 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms