Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chrac1Q9JKP8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms