Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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