Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lmbr1Q9JIT0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lmbr1Q9JIT0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lmbr1Q9JIT0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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