Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms