Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pop5Q9DB28 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pop5Q9DB28 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pop5Q9DB28 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pop5Q9DB28 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pop5Q9DB28 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms