Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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