Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Snapc3Q9D2C9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms