Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Exo5Q9CXP9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Exo5Q9CXP9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Exo5Q9CXP9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms