Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Sgo1Q9CXH7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Sgo1Q9CXH7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Sgo1Q9CXH7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Sgo1Q9CXH7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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