Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih4Q9CX13 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms