Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rprd1bQ9CSU0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rprd1bQ9CSU0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rprd1bQ9CSU0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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