Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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