Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nudt21Q9CQF3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms